TGAC conduce a disminuir el desarrollo amenaza para la más importante del Genoma Centro de Análisis de cropThe de Vietnam

IMAGEN: Esta imagen muestra un experimento en Vietnam para la prueba de tolerancia a la salinidad variedades de arroz derivadas de marcador de retrocruzamiento Asistida – MABC.view más

Crédito: AGI

Como el segundo mayor exportador mundial, arroz es el producto agrícola más importante de Vietnam. Un aumento dramático en la producción de arroz ha tenido lugar desde la década de 1980, debido a la expansión de las tierras cultivables y un cambio en las variedades del cultivo de producción de una sola rendimiento anual de dos y tres rendimientos por año.

Con un impresionante aumento de rendimiento anual del 3,3 por ciento a partir de 1987, la producción de arroz vietnamita ha beneficiado de la adopción de nuevas variedades de arroz y mejoras en la genética aplicada para avanzar en el mejoramiento de cultivos.

Sin embargo, hay una creciente amenaza para este cultivo vital de los factores asociados con el cambio climático, tales como patógenos emergentes y el aumento del nivel del mar, en las zonas de cultivo de arroz de Vietnam importante son predominantemente costera, así como las presiones ambientales del desarrollo urbano rápido.

El desarrollo de la capacidad de la bioinformática en Vietnam permitirá a los institutos de investigación se beneficien de los avances en la genómica de última generación, aplicando sus conocimientos de cálculo para el mejoramiento de arroz para ayudar a mantener la productividad de cara a los cambios climáticos, y potencialmente desarrollar nuevas variedades de mayor valor de arroz para el mercado global.

En colaboración con el Instituto de Genética Agricultura (AGI) en Hanoi (Vietnam), TGAC está trabajando para caracterizar la diversidad genética de las variedades tradicionales de arroz de Vietnam, con el objetivo de desarrollar marcadores genéticos asociados con rasgos de interés tales como resistencia a enfermedades y tolerancia a la sal.

Con la fase de investigación inicial de este proyecto explorar la diversidad genética de 36 variedades locales, este proyecto proporcionará fondos por un período de 48 variedades para ser analizados. Con el objetivo de aumentar este número a 600 en el futuro. La generación de estos grandes conjuntos de datos genómicos requiere experiencia en bioinformática con el fin de analizar los datos y el desarrollo de herramientas moleculares para ayudar a la cría de precisión para mejorar el arroz. (1)

La colaboración internacional entre TGAC y AGI se extenderá a un grupo más amplio de investigadores en Vietnam a través de talleres de formación para fomentar la capacidad bioinformática, utilizando arroz como un modelo. El programa consiste en el intercambio de científicos de Vietnam para ganar experiencia en el análisis de la bioinformática, y desde el Reino Unido para aprender acerca de las actividades de campo del fenotipo en Vietnam.

Un experimento en Vietnam para las pruebas de variedades de arroz tolerancia a la salinidad derivados de retrocruzamiento Asistida por Marcadores – MABCScientists de TGAC, AGI y otros participantes Institutos será el anfitrión de “formación de formadores” talleres en Norwich formar investigadores vietnamitas en bioinformática y análisis genómico para dotarlos de la habilidades para sostener la formación de investigadores en Vietnam para el futuro (2). Con el fin de hacer que los datos sean accesibles, TGAC creará una base de datos pública para albergar los datos de variantes dentro del contexto de las últimas asambleas del genoma y anotación.

líder del proyecto, Sarah Ayling, genómica de cultivos y el líder de grupo de la diversidad en TGAC, dijo: “La financiación Enlaces Institucionales ofrece una oportunidad para nosotros para entrenar a los científicos vietnamitas en bioinformática, y dotarlos de los conocimientos necesarios para capacitar a otros para ayudar a avanzar en su comprensión de la próxima genómica generación.

“Estos” entrenar al entrenador “actividades permitirán el flujo de conocimientos a otros investigadores de la región, proporcionando más científicos con el conjunto de habilidades necesarias para hacer uso de los datos genómicos para el mejoramiento del arroz y mejorar el rendimiento de los cultivos para las generaciones actuales y futuras en Vietnam.

“Nuestra asociación permitirá TGAC y el Reino Unido para proporcionar orientación sobre las mejores prácticas y, en colaboración con nuestros colegas vietnamitas, liderar el desarrollo de formas innovadoras de compartir los datos y mejorar la formación y actualización de las capacidades de los científicos en las áreas de la bioinformática y la genómica , a nivel mundial “.

El Dr. Le Huy jamón, Director General de AGI, ha añadido: “El proyecto para la formación de nuestros científicos en la bioinformática es de valor extremo; en nuestro instituto y en Vietnam, en general, tenemos buenos criadores de arroz, incluidos los criadores moleculares, pero tenemos no tienen expertos bioinformática, que pueden utilizar los datos de secuenciación genómica para la reproducción.

“Este proyecto nos ayudará con esto, donde, debido a nuestra colaboración con TGAC, sueño de nuestros científicos acerca de la aplicación de herramientas genómicas para el mejoramiento del arroz se convierte en una realidad, tras la primera fase de nuestra colaboración cuando hemos secuenciado los primeros 36 genomas de los locales arroz.”

“Tras el acuerdo con el Fondo Newton se firmó entre el MOST en Vietnam y la Embajada del Reino Unido en Hanoi, espero que esto traerá nuevas oportunidades para una mayor colaboración y herramientas genómicas llegará a ser ampliamente utilizado para el mejoramiento del arroz en Vietnam.”

fondo de Newton Enlaces Institucionales del British Council aborda áreas de investigación e innovación para apoyar el desarrollo económico y el bienestar social de los países de bajos y medianos ingresos con poblaciones pobres y vulnerables.

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