Nueva prueba detecta todos los virus que infectan a las personas, animales

Escuela de Medicina de la Universidad de Washington

Una nueva prueba desarrollada en la Escuela Universitaria de Medicina de Washington en St. Louis puede detectar prácticamente cualquier virus que infecta a las personas y animales, incluyendo el virus del Ébola (arriba) .Ver más

Crédito: Instituto Nacional de Alergias y Enfermedades Infecciosas

Una nueva prueba detecta prácticamente cualquier virus que infecta a las personas y animales, según un estudio de la Escuela Universitaria de Medicina de Washington en St. Louis, donde se desarrolló la tecnología.

Muchos miles de virus son conocidos por causar enfermedades en personas y animales, y hacer un diagnóstico puede ser un ejercicio exhaustivo, a veces requieren una batería de pruebas diferentes. Eso es porque las pruebas actuales no son lo suficientemente sensibles como para detectar niveles bajos de insectos o virales se limitan a detectar sólo los virus sospechosos de ser responsables de la enfermedad de un paciente.

“Con esta prueba, usted no tiene que saber lo que estás buscando”, dijo el autor principal del estudio, Gregory Storch, MD, la profesora Ruth L. Siteman de Pediatría. “Se proyecta una red amplia y puede detectar incluso los virus que están presentes en niveles muy bajos. Creemos que la prueba será especialmente útil en situaciones en las que el diagnóstico sigue siendo difícil después de la prueba estándar o en situaciones en las que se desconoce la causa de un brote de la enfermedad “.

Los resultados, publicados en línea en septiembre en el journalGenome Researchdemonstrate que en muestras de pacientes que la nueva prueba – llamada ViroCap – puede detectar los virus no encontraron mediante pruebas estándar basado en la secuenciación del genoma. La nueva prueba podría ser utilizado para detectar brotes de virus mortales como el Ébola, Marburg y el síndrome respiratorio agudo severo (SRAS), así como los virus más rutinarias, incluyendo rotavirus y norovirus, los cuales causan infecciones gastrointestinales graves.

Las secuencias de prueba y detecta los virus en muestras de pacientes y es tan sensible como los ensayos estándar de oro de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), que se utilizan ampliamente en los laboratorios clínicos. Sin embargo, incluso los ensayos de PCR más expansivas sólo pueden detectar hasta alrededor de 20 virus similares al mismo tiempo.

Los investigadores de la Universidad de Washington están haciendo la tecnología que desarrollaron públicamente a disposición de los científicos y médicos de todo el mundo, para el beneficio de los pacientes y la investigación.

Los investigadores evaluaron la nueva prueba en dos conjuntos de muestras biológicas – por ejemplo, la sangre, heces y las secreciones nasales – de los pacientes en el Hospital de Niños de St. Louis. En la primera prueba, norma que se basaba en la secuenciación del genoma habían detectado virus en 10 de 14 pacientes. Pero la nueva prueba encontró virus en los cuatro hijos que la prueba anterior había pasado por alto. las pruebas estándar no pudo detectar, virus comunes de cada día: la gripe B, una causa de la gripe estacional; Parechovirus, un gastrointestinal leve y virus respiratorio; virus del herpes 1, responsable de herpes labial en la boca; y el virus de la varicela-zoster, que causa la varicela.

En un segundo grupo de niños con fiebres inexplicables, las pruebas estándar virus había detectado 11 en los ocho niños evaluados. Pero la nueva prueba se encontró otra siete, incluyendo un virus respiratorio llamado adenovirus humano de tipo B 3A, que por lo general es inofensivo, pero puede causar infecciones graves en algunos pacientes.

En total, el número de virus detectados en los dos grupos de pacientes aumentó a 32 de 21, un aumento del 52 por ciento.

“La prueba es tan sensible que también detecta cepas variantes del virus que están estrechamente relacionados genéticamente”, dijo el autor correspondiente Todd Wylie, un instructor de pediatría. “Leves variaciones genéticas entre los virus a menudo no pueden ser distinguidos por las pruebas disponibles en la actualidad y complican capacidad de los médicos para detectar todas las variantes con una sola prueba.”

Además, debido a que la prueba incluye la información genética detallada acerca de diversas cepas de virus en particular, los subtipos se pueden identificar fácilmente. Por ejemplo, el estudio mostró que mientras que las pruebas estándar identifica un virus como la gripe A, que causa la gripe estacional, la nueva prueba indicó que el virus era un subtipo particularmente duro llamado H3N2.

la pasada temporada de gripe, H3N2 contribuyó a unas 36.000 muertes en los Estados Unidos. Y en algunos pacientes – niños en particular jóvenes, adultos mayores y las personas con sistemas inmunes debilitados – a sabiendas de que la cepa H3N2 está presente puede alterar el tratamiento.

Para desarrollar el ensayo, los investigadores dirigidos tramos únicas de ADN o ARN a partir de cada grupo conocido de virus que infecta seres humanos y animales. En total, el equipo de investigación incluyó a 2 millones de tramos singulares de material genético de los virus en la prueba. Estos tramos de materiales se utilizan como sondas para arrancan los virus en muestras de pacientes que son una coincidencia genética. El material viral emparejado a continuación, se analiza el uso de alto rendimiento de secuenciación genética. A medida que se descubren nuevos virus por completo, su material genético podría fácilmente ser añadido a la prueba, dijo Storch.

Los investigadores planean llevar a cabo investigaciones adicionales para validar la precisión de la prueba, por lo que podrían pasar varios años antes de que sea clínicamente disponibles.

“También puede ser posible modificar la prueba de modo que pudiera ser utilizado para detectar patógenos distintos de virus, incluyendo bacterias, hongos y otros microbios, así como genes que indican el patógeno es resistente al tratamiento con antibióticos u otros medicamentos, “dijo el co-autor Kristine Wylie, PhD, profesor asistente de pediatría.

Mientras tanto, la tecnología puede ser utilizada por los científicos para estudiar los virus en un entorno de investigación. Kristine Wylie investiga los virus que establecen su residencia en y sobre el cuerpo humano, conocidos colectivamente como la virome. La nueva prueba proporcionará una manera de captar la amplitud y profundidad de dichos virus, y profundizar la comprensión de la forma en que juegan un papel en mantener el cuerpo saludable.

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